Ботанический отдел в составе Зоологического музея Казанского университета на базе фондов кафедры ботаники был создан в 1991 году.
Одними из самых уникальных экспонатов-раритетов являются семена вельвичии удивительной (двулистное розеточное растение с толстым стволовидным стеблем, большую часть которого составляет гипокотиль – прим.ред.) – растения из Западной Африки, подлежащие охране.
В экспозиции представлены ископаемые остатки флор Татарстана, России и стран СНГ: камни с отпечатками листьев, ископаемая древесина и плоды разного геологического возраста. Коллекции охватывают огромный временной промежуток от перми до плейстоцена.